Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATMQ13315 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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