Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms