Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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