Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPRL3Q12980 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPRL3Q12980 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms