Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX10Q12887 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX10Q12887 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX10Q12887 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX10Q12887 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX10Q12887 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX10Q12887 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX10Q12887 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX10Q12887 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COX10Q12887 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms