Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms