Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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