Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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