Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX4Q06945 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms