Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms