Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHDQ02161 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHDQ02161 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHDQ02161 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHDQ02161 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHDQ02161 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms