Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN7AQ01118 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms