Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms