Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms