Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM193AP78312 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM193AP78312 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms