Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCS1P62166 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCS1P62166 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms