Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACTBP60709 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACTBP60709 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACTBP60709 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACTBP60709 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ACTBP60709 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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