Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms