Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT2P45379 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms