Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA2P42262 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms