Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms