Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA4P35212 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms