Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP6P35125 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP6P35125 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP6P35125 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP6P35125 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms