Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP1P30622 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms