Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms