Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms