Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRMP28827 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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