Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms