Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSPP15924 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms