Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH1P12830 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms