Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL6A2P12110 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms