Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A1P12074 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms