Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2AP11388 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms