Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms