Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC166P0CW27 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms