Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR89BP0CG08 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR89BP0CG08 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms