Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00032P0C843 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00032P0C843 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms