Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LCATP04180 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LCATP04180 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LCATP04180 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LCATP04180 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LCATP04180 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LCATP04180 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LCATP04180 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCATP04180 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCATP04180 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCATP04180 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCATP04180 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCATP04180 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCATP04180 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCATP04180 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCATP04180 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCATP04180 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms