Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms