Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM2O75603 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM2O75603 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM2O75603 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM2O75603 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM2O75603 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM2O75603 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms