Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPLO60437 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPLO60437 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPLO60437 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPLO60437 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPLO60437 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms