Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP104O60308 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP104O60308 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms