Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms