Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN1O60240 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms