Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRTO14522 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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