Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms