Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CLDN25C9JDP6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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