Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms