Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC144AA2RUR9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC144AA2RUR9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms