Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USH1CQ9Y6N9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USH1CQ9Y6N9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms